Хребет лосося состоит из 59-60 позвонков, которые примерно одинаковы по размеру от головы до хвоста. Последние несколько позвонков в хвосте изгибаются вверх, поддерживая эпиуральные пластины сверху и гипуральные пластины снизу, к которым крепятся лучи хвостового плавника и мышцы. Изгиб позвоночника вверх, скрытый вышележащими мышцами и сухожилиями, является связью с примитивным гетероцеркальным расположением хвоста предков телеостов. Головной мозг заключен в защитный череп, расположенный на переднем конце позвоночника, а спинной мозг проходит назад вдоль тела через нервные дуги на верхней (дорсальной) поверхности позвонков. Центральный отдел, или тело, каждого позвонка состоит из двух полых костных конусов, расположенных вершиной к вершине, в углублениях которых находится соединительная прокладка, отделяющая позвонки один от другого. На рентгеновских снимках такое биконическое расположение придает позвонкам здорового лосося характерный вид буквы "X". Повреждения, полученные в результате обработки, болезни или недоедания, хорошо видны на рентгенограммах (рис. 1.8). В области полости тела к каждому позвонку прикреплены два ребра, обеспечивающие поддержку мышечной стенки тела с обеих сторон. Сзади полости тела, в области хвоста, каждый позвонок несет гемовую дугу вентрально к перегородке. В канале, образованном гемальной дугой, находятся каудальная артерия, каудальная вена и каудальные лимфатические сосуды. Невральная и гематическая дуги переходят в позвоночник, который поддерживает срединную перегородку выше и ниже позвоночного столба, к которому прикреплены мышечные блоки по обе стороны рыбы. К этим шипам прикреплены опоры срединных плавников.
Парные плавники крепятся на грудном и брюшном поясах. Грудной пояс прикреплен к клиторальной кости, которая образует задний край оперкулярной полости. Тазовая кость не прикреплена ни к какой другой части скелета, а встроена в брюшную мышцу на две трети пути вдоль полости тела. Эта кость препятствует вентральному разрезу, обычно используемому при потрошении лосося.